Наталья Непряева родилась 6 сентября 1995 года в Твери, где и прошло ее детство. С малых лет увлекалась лыжным спортом, а со временем стала заниматься им профессионально.
Лыжами Наталья, по ее собственным словам, увлеклась с семи-восьми лет. Ее первым тренером стала мама - Ирина Непряева. Родители, которые и сами занимались лыжами, сумели привить дочери любовь к данному виду спорта. Впоследствии это сказалось на выборе ею именно спортивной карьеры.